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这些部队中的中级以上的将官，多半与主将有着千丝万缕的联系，他们之间不是本家叔伯兄弟，就是八拜之交的干兄弟。他们可谓是一荣俱荣，一损俱损，因此上阵搏杀的勇气和胆略不一定有，可维护主将、维护他们共同利益的心思那是铁铁的。

因此，这些以裙带关系爬上高位的，肯定是以“荐主”马首是瞻，脑子里根本没有什么朝廷法度和民族大义。所以，对于他们也就毋需客气，一俟将他们与部队隔离开来，就一定要采取严刑峻法以治之。对于他们的劣习，也要坚决予以压制，稍有不服，即可施以酷刑，甚至也不妨采取杀鸡骇猴的策略，即便全都弃之不用也没有什么好可惜的。

对这些人的总的原则，就是不能让他们有任何的侥幸心理，只允许他们老老实实接受朝廷的整编。

当然了，万事不能一概而论，其中或许也有着那么三两个具有真才实学，能够上阵搏杀，可以为朝廷效力之人，但一时之间恐怕也难辨真伪。所以，对待那些表现尚可的，既不能笼而统之地归入那些不可救药之类，可也不能轻信。

要对他们进行一段时间的关注，决不能轻易就放松对他们的管理。在整个整训结束之后，若是其中尚有可用之人，也尽量不让他们回以前的单位，避免他们旧习复发，重蹈以前的覆辙。

而总旗和小旗之类的下级校官，虽然其中也不乏依靠裙带关系而上位之人，可更多的是凭借自己的表现而获得的职位。其中的比例，应该与百户以上的那些人的情况正好相反，小部分是无用之辈，大部分是凭借着自己的勇气和胆略拼杀出来的。至于他们也依附于主将，惟主将马首是瞻，那也是无奈之举。若不然，他们也根本没有立足之地。

因此，他们之中的大部分人，就要做为此后整编之后部队的主干力量进行培养。

也就是因为要使用他们，因此对他们的训练要更加的严格。训练标准，依照当初招收大明狂飙人员那样，经过测试之后达不到标准的，可以再给一次重新训练的机会，若是测试再不合格，那就贬为普通兵士，一律不准升任。

对于那些训练中表现良好，没有劣习，测试又合格的人员，不仅要尽快予以安置，而且所享受的待遇，要保证较以前至少翻一番。若是立有功劳，也要进行相应的奖励。

大明王朝的卫所军士月粮是有一定之规的。

洪武年中，京城外各卫所马军月支米二石，步军总旗一石五斗，小旗一石二斗，军士一石。城守者（守卫城镇）如数给，屯田者半之。

另外，民匠充军者八斗，牧马千户所一石，民丁编军操练者一石。

江阴横海水军稍班、碇手一石五斗。

阵亡病故军，给予丧费一石，在营病故者半之。